Wednesday, September 17, 2025
| Time | Event | (+) |
| 09:30 - 10:00 | Welcome - - | |
| 10:00 - 10:15 | Presentation of the Summer School and Graduate School HeaDS - Julien Pothlichet (Inserm UMR 996, Université Paris Saclay) et Delphine Joseph (UMR CNRS 8076 BIOCIS, Université Paris Saclay) | |
| 10:15 - 10:45 | Round Table: Presentation of the participants - - | |
| 10:45 - 12:20 | - 10h45-11h35 – L'humain-microbien, une symbiose à préserver - Joel Doré (Directeur de recherche INRAE, INRAE, Institut MICALIS, Université Paris-Saclay, AgroParisTech et directeur scientifique du centre d’excellence en analyse du microbiome MetaGenoPolis, Domaine de Vilvert, 78350 JOUY-EN-JOSAS – France) 11h35-12h20 – Microbiote de la peau et des plaies cutanées - Anne Jamet (MCU-PH Institut Necker-Enfants Malades - Team Host-Pathogen Integrative Biology & Service de Microbiologie Clinique Hôpital Necker, Paris) | |
| 12:20 - 14:00 | Lunch | |
| 14:00 - 14:45 | - 14h00-14h45 – Présentation de méthodes bioinformatiques optimisées pour l’exploration du lien entre microbiote et santé humaine par utilisation de données métagénomiques - Mathieu Almeida (Chargé de Recherche, INRAE, MetaGenoPolis, Jouy-en-Josas) | |
| 14:45 - 17:10 | - 14h45-15h30 – Microbiote, pathologies intestinales et comportement alimentaire - Pr David Ribet (PhD, Chargé de Recherche INSERM, Prof. École Polytechnique, Unité Nutrition, Inflammation et Axe Microbiote-Intestin-Cerveau, INSERM U1073, Université de Rouen, Lab Website : http://u1073lab.univ-rouen.fr) 15h50-16h35 - Rôle du bactériome dans la progression et la réponse aux traitements du cancer - Océane Martin (PhD, HDR, Maître de conférences en microbiologie clinique, Université de Bordeaux - CNRS U5095) 16h35-17h10 – Diet-microbiota interactions --- A personalized point of view - Benoit Chassaing (Head – Microbiome/Host Interactions, Institut Pasteur, U1306 INSERM, Université Paris Cité, Paris, France) | |
| 15:30 - 15:50 | Coffee break – Networking - Discussion with sponsors | |
| 17:10 - 18:00 | Discussion with sponsors | |
| 18:00 - 19:00 | Check in Hotel - - | |
| 19:00 - 20:00 | Networking - Cocktail | |
| 20:00 - 21:00 | Dinner | |
| 21:00 - 22:30 | - Joel Doré (Directeur de recherche INRAE, Institut MICALIS, Université Paris-Saclay, AgroParisTech) et directeur scientifique du centre d’excellence en analyse du microbiome MetaGenoPolis) |
Thursday, September 18, 2025
| Time | Event | (+) |
| 09:00 - 10:30 | - 9h00-9h45 – Microbiote fongique : diversité et rôle sur la santé humaine - Mathias Richard (Directeur de recherche INRAE, Equipe Probihote, Institut MICALIS, Université Paris-Saclay, AgroParisTech, Domaine de vilvert, 78350 Jouy en Josas, France) 9h45-10h30 – The fungal microbiota in chronic respiratory infections - Pr Françoise Botterel (PU-PH, Unité de Parasitologie - Mycologie, Département de Prévention, diagnostic et traitement des infections, Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne (UPEC), CHU Henri Mondor, 94000 Créteil, France | EA 7380 DYNAMYC, Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne (UPEC), Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort (ENVA), Faculté de Médecine de Créteil, 94010 Créteil, France ) | |
| 10:30 - 10:50 | Coffee break – Networking - Discussion with sponsors | |
| 10:50 - 12:20 | - 10h50-11h35 – Remote control of immune surveillance to cancer by intra-tumoral microbiota - Mathias Chamaillard (DR2 INSERM, INSERM UMR1003, Université des Sciences et Technologies de Lille - Lille I, ONCOLille, 59000 Lille - France) 11h35-12h20 – Integrating the Microbiota as a Component of the Pancreatic Cancer Microenvironment for the Development of Novel Therapeutics and Biomarkers - Victoire Ruffino (PhD, Unité Biologie Cellulaire et Cancer, CNRS UMR144, équipe Oncologie Moléculaire, Institut Curie, Paris - France) | |
| 12:20 - 14:00 | Lunch | |
| 14:00 - 15:30 | - 14h00-14h45 - Microbiote intestinal et médicament : impact sur la pharmacocinétique et la réponse au traitement - Patrick Jimonet (PhD, Chef de projets Innovation Microbiote, Medicen Microbiome Drug Metabolism Working Group, Medicen, Paris) 14h45-15h30 – Modèles in vitro d'interaction des microbiotes avec les xénobiotiques - Alexandre Crépin (MCU, laboratoire Ecologie et Biologie des Interactions (EBI) UMR CNRS 7267, Université de Poitiers) | |
| 15:30 - 15:50 | Coffee break – Networking - Discussion with sponsors | |
| 15:50 - 17:10 | - 15h50-16h35 – IOScope, diagnostic in vitro prédisant la réponse aux immunothérapies du cancer, grâce à un biomarqueur tiré du microbiote - Etienne Formstecher (CEO, GMT Science, Bringing microbiomics to the clinic, https://gmt.bio, Paris - France) 16h35-17h10 – An overview of microbiome research at Danone - Vincent Thomas (Senior Team Leader Gut Microbiology and OneBiome, Danone Global Research & Innovation Centre, Gif-sur-Yvette - France) | |
| 17:10 - 18:10 | - 4 Intervenants : - Etienne Formstecher (CEO, GMT Science, Bringing microbiomics to the clinic, https://gmt.bio, Paris - France) - Vincent Thomas (Senior Team Leader Gut Microbiology and OneBiome, Danone Global Research & Innovation Centre, Gif-sur-Yvette - France) - Océane Martin (PhD, HDR, Maître de conférences en microbiologie clinique, Université de Bordeaux - CNRS U5095 - France) - Alexandre Crépin (MCU, laboratoire Ecologie et Biologie des Interactions (EBI) UMR CNRS 7267, Université de Poitiers - France) | |
| 18:00 - 19:00 | Discussion with sponsors | |
| 19:00 - 19:00 | Departure - End of the Summer School |